Jan Koller má na svém kontě 30 zápasů v nejvyšší soutěži a vsítil v nich 5 gólů. Do ligy vstoupil v sezóně 1994/95 v dresu Sparty a za jiný klub v nejvyšší soutěži nehrál; ve Spartě také získal jeden titul.

Za reprezentaci odehrál Jan Koller 91 zápasů a vstřelil v ní 55 gólů; zúčastnil se MS 2006, ME 2000, ME 2004 a ME 2008.